Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Fndc4Q3TR08 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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