Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms