Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms