Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc127Q3TC33 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc127Q3TC33 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms