Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VrtnQ3SYK4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms