Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms