Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms