Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms