Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd11Q1RNF8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms