Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm1123Q1RME4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm1123Q1RME4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm1123Q1RME4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm1123Q1RME4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm1123Q1RME4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm1123Q1RME4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm1123Q1RME4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms