Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300lgQ1ERP8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms