Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ptchd1Q14B62 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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ptchd1Q14B62 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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ptchd1Q14B62 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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