Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rpusd3Q14AI6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rpusd3Q14AI6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms