Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930480E11RikQ0VG34 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms