Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms