Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms