Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms