Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kndc1Q0KK55 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms