Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms