Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc7a1Q09143 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc7a1Q09143 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms