Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col9a2Q07643 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms