Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col17a1Q07563 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms