Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms