Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aplp2Q06335 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aplp2Q06335 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms