Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r236Q05A06 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r236Q05A06 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms