Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SryQ05738 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SryQ05738 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SryQ05738 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SryQ05738 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SryQ05738 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms