Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1Q04750 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms