Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms