Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms