Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelaQ04207 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms