Protein–RNA interactions for Protein: Q03526

Itk, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItkQ03526 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItkQ03526 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItkQ03526 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItkQ03526 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItkQ03526 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItkQ03526 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms