Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms