Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms