Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms