Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms