Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb2Q00977 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms