Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Serpina1cQ00896 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms