Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd80Q00609 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms