Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms