Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PgrQ00175 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PgrQ00175 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms