Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms