Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds1P98191 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds1P98191 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms