Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms