Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmklr1P97468 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms