Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bop1P97452 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bop1P97452 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms