Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43bP86448 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms