Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms