Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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