Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb2P81069 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gabpb2P81069 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms