Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms